Началось строительство ансамбля с Малого Никольского храма, названного в память о Никольской церкви, существовавшей в Прохоровке с конца 80-х годов XIX в до 30-х годов XX в. С начала 90-х годов в Прохоровке уже существовал свой приход, потому Малый храм был построен для повседневных церковных треб, пока готовилось строительство Петропавловского храма.

Итак, Малый храм первым принял прихожан, это случилось 23 апреля 1994 года, в Лазареву субботу, за неделю до Пасхи в храме начались богослужения.

Основное назначение храма - нести повседневную службу при большом храме-памятнике, этим объясняется его скромный и даже будничный внешний вид.

Сейчас в нём совершаются различный требы: крещения, молебны, панихиды и т.д.

Престольный праздник храма, память святителя Николая - 6/19 декабря.